Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx1-2P42580 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms