Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Mmp9P41245 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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