Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa2P31245 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms