Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pou5f1P20263 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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