Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NelfeP19426 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NelfeP19426 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms