Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms