Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

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Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DmdP11531 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DmdP11531 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DmdP11531 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DmdP11531 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DmdP11531 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
DmdP11531 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
DmdP11531 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DmdP11531 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
DmdP11531 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DmdP11531 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DmdP11531 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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DmdP11531 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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DmdP11531 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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DmdP11531 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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DmdP11531 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DmdP11531 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DmdP11531 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
DmdP11531 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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DmdP11531 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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DmdP11531 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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DmdP11531 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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DmdP11531 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
DmdP11531 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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