Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P10404 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P10404 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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