Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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