Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ComtO88587 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ComtO88587 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ComtO88587 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ComtO88587 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms