Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms