Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Degs1O09005 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms