Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms