Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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