Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm20795J3QP49 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm20795J3QP49 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm20795J3QP49 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20795J3QP49 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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