Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm6176J3QK59 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms