Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r58G3X9U3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms