Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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