Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmgcF6VRN1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SmgcF6VRN1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
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