Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Zfp988F6VKC7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Zfp988F6VKC7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Zfp988F6VKC7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Zfp988F6VKC7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Zfp988F6VKC7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms