Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms