Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clip3B9EHT4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms