Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnldc1B2RXZ1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnldc1B2RXZ1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms