Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms