Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5640A3KG49 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5640A3KG49 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5640A3KG49 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5640A3KG49 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5640A3KG49 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5640A3KG49 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5640A3KG49 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5640A3KG49 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5640A3KG49 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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