Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Gpc1Q9QZF2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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