Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod4Q9JLH8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmod4Q9JLH8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms