Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ldb3Q9JKS4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms