Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfrsf23Q9ER63 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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