Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pfdn1Q9CWM4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn1Q9CWM4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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