Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BccipQ9CWI3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms