Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PompQ9CQT5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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PompQ9CQT5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PompQ9CQT5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PompQ9CQT5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PompQ9CQT5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PompQ9CQT5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms