Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Nicn1Q9CQM0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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