Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms