Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pagr1aQ99L02 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms