Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc30a1Q99J38 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc30a1Q99J38 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc30a1Q99J38 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc30a1Q99J38 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc30a1Q99J38 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc30a1Q99J38 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc30a1Q99J38 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc30a1Q99J38 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc30a1Q99J38 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ttc30a1Q99J38 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ttc30a1Q99J38 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc30a1Q99J38 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc30a1Q99J38 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc30a1Q99J38 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc30a1Q99J38 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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