Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms