Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms