Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b3Q921M3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms