Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atl3Q91YH5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms