Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim29Q8R2Q0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms