Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Prpf39Q8K2Z2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prpf39Q8K2Z2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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