Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rbm48Q8K2X2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms