Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Otud6bQ8K2H2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otud6bQ8K2H2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud6bQ8K2H2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud6bQ8K2H2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud6bQ8K2H2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud6bQ8K2H2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud6bQ8K2H2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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