Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Fcho1Q8K285 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fcho1Q8K285 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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