Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim68Q8K243 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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