Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms