Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cpped1Q8BFS6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cpped1Q8BFS6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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