Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pdcl2Q78Y63 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2Q78Y63 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms