Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms